Разные модели микроволновых печей в зависимости от фирмы-производителя и модификации имеют различные режимы работы. В простой микроволновой печи, оборудованной лишь магнетроном, можно готовить только в микроволновом режиме. Комбинированные печи, сочетающие функции микроволновой печи, гриля и духовки, кроме того, позволяют обрабатывать пищу в режимах «Гриль» и «Горячий воздух», а также в комбинированных и автоматических режимах.
Некоторые комбинированные микроволновые печи включают в свой состав нагревательную спираль и вентилятор, обеспечивающие конвекционную обработку продуктов.
Многие современные комбинированные микроволновые печи оборудованы системами автоматики. В зависимости от модели и фирмы-производителя такие печи могут выполнять в автоматических режимах функции размораживания, разогревания, приготовления, грилирования, комбинированной обработки.